Музей основан 18 мая 2000 г. – в Международный день музеев. Именно в этот день была оформлена первая экспозиция, рассказывающая об основных полезных ископаемых Алтайского края и о некоторых минералах и горных породах различных регионов России. Коллекции музея являются частью коллекционного фонда одного из крупнейших музеев России, находящегося с 1951 г. в Новокузнецке. После образования в Алтайском крае Комитета природных ресурсов часть коллекционного фонда была передана безвозмездно на постоянное хранение во вновь создаваемый геологический музей г.Барнаул.
Общее число единиц хранения – 1000 образцов.
Общая площадь музея – 46 м2, под экспозицией – 28 м2.
Основные темы экспозиции:
· минерально-сырьевая база Алтайского края;
· систематика минералов;
· цветные камни Алтайского края и других регионов;
· каменная скульптура.
Обменный фонд музея предлагает минералы и руды крупнейших месторождений Рудного Алтая.
Сотрудники музея курируют работу геологических кружков школ г. Барнаула и края. Для широкого посещения музей закрыт. Его посещают только сотрудники Федерального государственного учреждения и комитета природных ресурсов.