Музей основан в середине 80-х годов XIXстолетия первым профессором геологии в России академиком А.А.Иностранцевым при кафедре исторической геологии. Составившие коллекции собирались с 1834 г. Музей подчиняется деканату геологического факультета.
Общее число единиц хранения – 5500 единиц.
Общая площадь музея – 250 м2, под экспозицией – 200 м2.
Музей состоит из двух отделов – научно-монографического и учебного.
Научная часть музея содержит оригиналы объектов, монографически изуенных сотрудниками и аспирантами университета. Эти коллекции являются документальной палеонтологической основой стратиграфического расчленения осадочных образований фанерозоя из различных районов бывшего Советского Союза.
Особый интерес представляют коллекции оригиналов к классическим трудам ученого-энциклопедиста Э.И.Эйхвальда.
Учебная часть музея представлена собранием осадочных горных пород и ископаемой фауны; содержание экспозиций – развитие жизни на Земле.
Основные направления деятельности – учебная, научная, экспозиционная.