Музей является структурным подразделением Северо-Восточного комплексного научно-исследовательского института.
Музей основан в 1977 году, открыт для посещения в 1981 году. Значительную часть собрания составили коллекционные сборы ведущих сотрудников института.
В музее открыты залы – Геологический, Минералогический, Археолого-этнографический и мемориальный кабинет им. Н.А. Шило.
Главной задачей музея является пропаганда знаний о геологическом строении, истории развития, полезных ископаемых и археологии Северо-Востока России.
Общее число единиц хранения – 10 000 экземпляров, в экспозиции – 3500.
Общая площадь музея – 360 м2 (два зала экспозиции и два кабинета).
Основные темы экспозиции:
· космос;
· эволюция биосферы;
· метеориты;
· петрография изверженных пород Северо-Востока;
· полезные ископаемые Северо-Восточного региона;
· цветные камни;
· систематическая минералогия (на основе уральской типовой коллекции).
Музей располагает одной из богатейших в России коллекцией метеоритов. Среди них выделяются два наиболее редких типа – гексаэдрит Билибино (1000 кг) и палласит Омолон (250 кг).
Северо-Восток России – самая перспективная по богатству и разнообразию провинция мира. В музее демонстрируется богатейшая коллекция цветных, поделочных и полудрагоценных камней.
Силами сотрудников музея и института выполняются оригинальные научные исследования, связанные с изучением метеоритов и самоцветов.